El jugador asume el papel del Agente A, un agente secreto asignado para atrapar a un espía enemigo peligroso que ha estado apuntando a otros agentes. El juego tiene lugar en la guarida secreta del antagonista principal, Ruby La Rouge. Después de presenciar el plan de infiltración de La Rouge que conduce a la supuesta desaparición del jefe del Agente A en el video del prólogo, el jugador es llevado a la guarida secreta en la costa, no lejos del crimen cometido. Luego, el jugador reúne elementos clave ocultos en sitios alrededor de ciertas partes de la guarida que lo llevarán a desbloquear nuevas áreas con la esperanza de finalmente ponerse al día y derrotar a La Rouge. Recopilar los elementos clave y utilizarlos en el entorno para resolver los acertijos es la mecánica principal, al tiempo que se confía en el buen ojo, la lógica y la memoria del jugador.
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