Prison Architect te coloca en la posición de ser alcaide y arquitecto de tu prisión a la vez. Tiene una serie de tutoriales donde aprendes a través de prisiones construidas el funcionamiento del juego, y tras esto, se puede jugar bien en esas prisiones, bien en una nueva. En la segunda opción tienes la posibilidad de empezar de cero, montando duramente en el día a día tu prisión, o bien esto mismo pero con dinero ilimitado.
Fugas, motines, tráfico de armas, drogas y herramientas será tu día a día en la prisión, donde deberás contratar a todo el personal necesario para su correcto funcionamiento mientras mantienes bajo control a los presos y sobretodo, a tu presupuesto financiero.