| 1. | Deus Ex #26: "NYC: Ship Lower Decks" | 2,614 | | Deus Ex
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| 2. | Deus Ex #22: "Hong Kong: VersaLife Level 2" | 2,368 | | Deus Ex
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| 3. | Deus Ex #7: "NYC: Hell's Kitchen - NSF Warehouse Generator" | 2,365 | | Deus Ex
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| 4. | Deus Ex #0: "Training" | 1,868 | | Deus Ex
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| 5. | Deus Ex #14: "NYC: Hell's Kitchen - 20th Street Warehouse" | 1,260 | | Deus Ex
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| 6. | Deus Ex #20: "Hong Kong: Meeting Tracer Tong" | 1,016 | | Deus Ex
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| 7. | Deus Ex #18: "Hong Kong: Tonnochi Road" | 943 | | Deus Ex
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| 8. | Deus Ex #4: "NYC: Hell's Kitchen - 'Ton Hotel" | 867 | | Deus Ex
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| 9. | Deus Ex #15: "UNATCO Return" | 780 | | Deus Ex
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| 10. | Deus Ex #21: "Hong Kong: VersaLife" | 586 | | Deus Ex
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| 11. | Deus Ex #23: "NYC: Hell's Kitchen Return" | 539 | | Deus Ex
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| 12. | Deus Ex #6: "NYC: Hell's Kitchen - Smuggler's Request" | 501 | | Deus Ex
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| 13. | Deus Ex #35: "Vandenburg: Tunnels" | 451 | | Deus Ex
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| 14. | Deus Ex #17: "Hong Kong: Wan Chai Market" | 385 | | Deus Ex
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| 15. | Deus Ex #11: "NYC: Airfield" | 347 | | Deus Ex
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| 16. | Deus Ex #9: "NYC: Battery Park - Brooklyn Bridge Station" | 316 | | Deus Ex
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| 17. | Deus Ex #33: "Paris: Morgan Everett's House" | 316 | | Deus Ex
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| 18. | Deus Ex #5: "NYC: Hell's Kitchen - Clinic/Underworld Tavern" | 270 | | Deus Ex
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| 19. | Deus Ex #3: "NYC: Battery Park" | 264 | | Deus Ex
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| 20. | Deus Ex #25: "NYC: Brooklyn Naval Assembly Building and Ship" | 261 | | Deus Ex
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| 21. | Deus Ex #13: "NYC: Hell's Kitchen - Helping Paul" | 244 | | Deus Ex
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| 22. | Deus Ex #39: "New West Coast: Ocean Lab" | 240 | | Deus Ex
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| 23. | Deus Ex #1: "Liberty Island" | 232 | | Deus Ex
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| 24. | Deus Ex #16: "MJ12 Heliport" | 224 | | Deus Ex
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| 25. | Deus Ex #19: "Hong Kong: Tonnochi Road Return" | 202 | | Deus Ex
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| 26. | Deus Ex #28: "Paris: Denfert-Rochereau" | 198 | | Deus Ex
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| 27. | Deus Ex #31: "Paris: Chateau DuClare" | 195 | | Deus Ex
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| 28. | Deus Ex #14: "Secret MJ12 Base" | 193 | | Deus Ex
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| 29. | Deus Ex #40: "New West Coast: Ocean Lab Universal Constructor" | 164 | | Deus Ex
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| 30. | Deus Ex #24: "NYC: Brooklyn Naval Shipyards" | 164 | | Deus Ex
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| 31. | Deus Ex #8: "UNATCO HQ 2" | 161 | | Deus Ex
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| 32. | Deus Ex #10: "NYC: Helibase" | 160 | | Deus Ex
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| 33. | Deus Ex #27: "NYC: Lower East Side Cemetery" | 153 | | Deus Ex
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| 34. | Deus Ex #45: "Area 51: Page" | 142 | | Deus Ex
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| 35. | Deus Ex #41: "New West Coast: Missile Silo" | 137 | | Deus Ex
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| 36. | Deus Ex #32: "Paris: Cathedral" | 117 | | Deus Ex
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| 37. | Deus Ex #37: "Vandenburg: Gas Station" | 110 | | Deus Ex
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| 38. | Deus Ex #43: "Area 51: Entrance" | 92 | | Deus Ex
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| 39. | Deus Ex #29: "Paris: Catacombs" | 87 | | Deus Ex
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| 40. | Deus Ex #38: "New West Coast: Sub Base" | 86 | | Deus Ex
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| 41. | Deus Ex #30: "Paris: Near Champs Elysses" | 77 | | Deus Ex
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| 42. | Deus Ex #42: "Area 51: Surface" | 76 | | Deus Ex
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| 43. | Deus Ex #2: "UNATCO HQ" | 69 | | Deus Ex
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| 44. | Deus Ex #34: "Vandenburg: Command Building" | 66 | | Deus Ex
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| 45. | Deus Ex #44: "Area 51: End" | 52 | | Deus Ex
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| 46. | Deus Ex #36: "Vandenburg: Command Return" | 50 | | Deus Ex
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| 47. | Deus Ex #12: "UNATCO #3" | 49 | | Deus Ex
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